Secția clinică de Gastroenterologie a fost înființată în februarie 2010 în urma desprinderii de secția de Medicină Internă. Apariția acesteia a fost un pas necesar în dezvoltarea Spitalului Clinc de Urgență “Sf. Ioan” a cărei funcționare pe vechea structură, bazată pe secții supradimensionate nu mai era de actualitate.
După anii ’90, medicina s-a schimbat destul de mult si a urmat o perioadă de tranziție în care medicina bazată pe procedee de diagnostic și tehnici terapeutice intervenționale a înlocuit în mare masură medicina clinică. Aceasta a condus către oportunitatea specializării sau supraspecializării în specialitățile medicale și chirurgicale de bază.
Secția clinică de Gastroenterologie a dezvoltat și a introdus în premieră, mai multe tehnici angiografice avansate, destinate patologiei hepatice: Șuntul transjugular intrahepatic, Măsurarea gradientului portocav și a presiunii suprahepatice blocate la bolnavii cu ciroză hepatică, embolizarea parțial splenică. Un alt aspect important al activității desfășurate de colectivul secției clinice de Gastroenterologie o reprezintă participarea la programul național AP-ENDO, privind tratamentul endoscopic al pacienților critici cu hemoragie digestivă superioară și protezare endoscopică digestivă înființat de Ministerul Sănătății prin Ord. nr. 875 din 10 iulie 2015, la care Spitalul Clinic de Urgență “Sf. Ioan” este parte. Prin acest program, sunt rezolvate urgențele digestive 24 de ore, 7 zile din 7 printr-un sistem de gardă la domiciliu “on-call”.